Name: Cómo trabajar con secuencias proteicas: obtención y manejo básico (EducaFarma 4.0)
Start: 2016-03-02T16:00:00+01:00
End: 2016-03-02T20:00:00+01:00
Location: Universidad de Salamanca

About the event

Categories:: Pharmacy

Keywords:: analisis; bioinformática; farmacia; proteinas

Profesorado:

           Nombre: Dr. Raúl Rivas González

           Departamento: Microbiología y Genética

           Correo electrónico: raulrg@usal.es

          

           Nombre: Dra. Esther Menéndez Gutiérrez

           Departamento: Microbiología y Genética

           Correo electrónico: esthermenendez@usal.es

  

 Datos de la Actividad:

           Duración: 3 horas

           Días: 2 de Marzo 2016

           Horario: 16:00-19:00 horas

           Lugar: Sala de ordenadores IMAC2. Facultad de Medicina

           Nº de Plazas: 20

  

 Enfocado a: Alumnos de los grados de Farmacia, Biología, Ciencias Ambientales, Química, Biotecnología y otras titulaciones de ciencias, así como personal investigador en formación, investigadores, personal técnico y docentes interesados en la materia, que no tengan ningún conocimiento en bioinformática y que deseen adquirir conceptos y aprender herramientas básicas relacionadas.

  

 Conocimientos previos: Conocimientos de informática a nivel de usuario (Internet, e-mail, MS Word…). Es deseable, pero no imprescindible haber participado en el curso anterior sobre análisis de secuencias de ADN.

  

 Objetivos:

 -Adquisición de conocimientos en conceptos básicos para el análisis bioinformático de proteínas.

 -Manejar las distintas herramientas bioinformáticas disponibles, software y online.

 -Búsqueda en bases de datos públicas.

  

 Contenidos:

 - Introducción a la bioinformática. Ventajas de trabajar con secuencias proteicas respecto a las nucleotídicas.

 - Formatos de secuencias proteicas.

 - Bases de datos. Comparación de secuencias.

 - Alineamiento múltiple de secuencias proteicas.

 - Predicción de dominios proteicos.

 - Modelización y predicción de estructura proteica.

 - Ejemplos prácticos.

  

 Metodología/Programación:

 16:00 h - Introducción a la bioinformática. Ventajas de trabajar con secuencias proteicas respecto a trabajar con secuencias nucleotídicas.

 16:15 Formatos de secuencias proteicas. Conversión de secuencias nucleotídicas a proteicas.

 16:45 Bases de datos. Comparación de secuencias. Introducción a BLAST. Ejemplos prácticos.

 17:30 Descanso.

 17:45 Alineamiento múltiple de secuencias proteicas. Programas de alineamiento múltiple. Uso práctico.

 18:15 Predicción de dominios proteicos. Uso práctico de programas online de predicción de dominios.

 18:30 Modelización y predicción de estructura proteica. Ejercicio de modelización de una secuencia proteica.

  

 Programas/Utilidades necesarias:

  

 Todos los programas utilizados son gratuitos y están disponibles online.

  

 <span style="font-family: 'Helvetica Neue', helvetica, arial, sans-serif; margin: 0px; padding: 0px; -webkit-margin-before: 0px; -webkit-margin-after: 0px; -webkit-margin-start: 0px; -webkit-margin-end: 0px; border: 0px; outline: 0px; font-size: 14px; font-weight: 700; color: rgb(69, 69, 69);">NOTA: Si el curso se llena y están interesado en realizarlo, manda un mail a fercb@usal.es indicando tu nombre completo y entrarás en la lista de espera. Si alguna plaza quedara libre, se te mandaría un correo para confirmar tu asistencia.

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